Στις 14 Ιουλίου του 1992 ο Νίκος Γκάλης συμφωνεί να συνεχίσει την καριέρα του στον Παναθηναϊκό. Την περίοδο εκείνη οι αδερφοί Γαννακόπουλοι στην προσπάθειά τους μεταμορφώσουν την ομάδα και να την κάνουν υπερδύναμη σε Ελλάδα και Ευρώπη αποφασίζουν να κάνουν κάποιες μεταγραφικές κινήσεις που υπερβαίνουν τα μέχρι τότε δεδομένα του συλλόγου. Η μεταγραφή κόστισε 1 δις δραχμές και αποτέλεσε μια από τις μεγαλύτερες της εποχής.
Ο Γκάλης πήρε την απόφαση να εγκαταλείψει τον Άρη όπου μεγαλούργησε για 13 χρόνια, καθώς ήρθε σε σύγκρουση με τη διοίκηση του συλλόγου. Ο νέος τότε πρόεδρος των Θεσσαλονικέων, Θεόφιλος Μητρούδης προσπάθησε να συμμαζέψει τα οικονομικά της ομάδας, που βρισκόταν στο χείλος της χρεωκοπίας. Το συμβόλαιο του Γκάλη ήταν δυσβάσταχτο και όταν ο παίκτης αρνήθηκε να του γίνει μείωση μισθού ήρθε το «διαζύγιο».
Όσο ο Γκάλης κυκλοφορούσε ελεύθερος, όπως ήταν φυσικό πολλές ομάδες θέλησαν να τον εντάξουν στο δυναμικό τους. Ο Ολυμπιακός που την περίοδο εκείνη άρχιζε να κυριαρχεί, αλλά και το αντίπαλο του δέος στη συμπρωτεύουσα, ο ΠΑΟΚ επιχείρησαν να τον αποκτήσουν όμως εκείνος προτίμησε το «τριφύλλι».
Ο Παναθηναϊκός προερχόταν από την χειρότερη σεζόν του τα τελευταία χρόνια, καθώς είχε τερματίσει 8ος στο πρωτάθλημα και είχε μείνει για πρώτη φορά εκτός Ευρώπης ύστερα από το 1967. Οι αδερφοί Γιαννακόπουλοι ήθελαν να φτιάξουν μια ομάδα που θα πρωταγωνιστούσε και εκτός από τον Γκάλη, πήραν εκείνο το καλοκαίρι τους Στόγιαν Βράνκοβιτς και Άριαν Κόμαζετς. Προπονητής ήταν ο Ζέλικο Παβλίσεβιτς.
Την πρώτη χρονιά του στην ομάδα ο Γκάλης οδηγεί τους «πράσινους» στην κατάκτηση του Κυπέλλου κόντρα στον αγαπημένο του Άρη και στους τελικούς του Πρωταθλήματος όπου ηττάται, αν και είχε πλεονέκτημα έδρας από τον Ολυμπιακό. Την επόμενη χρονιά η ομάδα στην τρίτη θέση της Ευρώπης στο φάιναλ φορ του Τελ Αβίβ για πρώτη φορά στην ιστορία της ωστόσο το όνειρο του Γκάλη για έναν ευρωπαϊκό τίτλο με σύλλογο δεν θα γίνει ποτέ πραγματικότητα.
Στις 29 Σεπτεμβρίου 1995 μετά από διαφωνία με τη διοίκηση και τον προπονητή του Κώστα Πολίτη, εγκατέλειψε την ομάδα, αλλά και την ενεργό δράση.
Πηγή: sday.gr