Ο Γιώργος Βαγιαννίδης έχει να αγωνιστεί με τη φανέλα του Παναθηναϊκού από το ντέρμπι κόντρα στην ΑΕΚ στα τέλη Σεπτεμβρίου, αφού στη συνέχεια έμενε εκτός αποστολής. Αυτό ήταν ένα μήνυμα της πράσινης διοίκηση σχετικά με την διαδικασία των συζητήσεων του συμβολαίου του, το οποίο εκπνέει το καλοκαίρι.
Όμως, το τελευταίο χρονικό διάστημα, ο Παναθηναϊκός αποφάσισε να ενεργοποιήσει και πάλι τον διεθνή αμυντικό και αναμένεται να είναι κανονικά στην αποστολή για το Ηράκλειο με τον ΟΦΗ και ο Ντιέγκο Αλόνσο θα μπορεί να τον χρησιμοποιήσει και πάλι.
Το επόμενο διάστημα θα γίνουν νέες διαπραγματεύσεις με τον ποδοσφαιριστή για την ανανέωση του συμβολαίου του.