Ο Μπόμπαν έφυγε από τη ζωή στις 28 Ιουνίου του 2006, βυθίζοντας στο πένθος εκτός από την οικογένειά του και ολόκληρο το ελληνικό μπάσκετ.
Η αγάπη του και το πάθος του για το άθλημα ήταν τόσο μεγάλη που ούτε τον ίδιο του τον εαυτό δεν λογάριασε όταν χτύπησε με απίστευτα μεγάλη δύναμη το κεφάλι του στην μπασκέτα σε εκείνο το παιχνίδι της 28ης Απριλίου του 1993.
Μία καταραμένη φάση σε ένα απλό παιχνίδι μπάσκετ ήταν αρκετή για να χαραμίσει ένας νέος άνθρωπος τη ζωή του. Όχι μόνο έμεινε 13 χρόνια καθηλωμένος στο καροτσάκι, αλλά στη συνέχεια υπέστη και καρδιακή προσβολή φεύγοντας από τη ζωή σε ηλικία 43 ετών.
Η 28η Απριλίου του 1993 λοιπόν, έμελλε να είναι η μέρα όπου θα διαδραματιζόταν το πιο δραματικό επεισόδιο που έγινε ποτέ σε γήπεδο μπάσκετ στην Ελλάδα.
Ήταν ένα απλό παιχνίδι ανάμεσα στον Πανιώνιο και τον Παναθηναϊκό και τίποτα δεν προμήνυε την συνέχεια που όλοι γνωρίζουμε.
Ο Πανιώνιος ήταν στην επίθεση, ο Γιάνκοβιτς χρεώθηκε με επιθετικό φάουλ (το 5ο του στον αγώνα) πάνω στον Αλβέρτη και δευτερόλεπτα μετά το μυαλό του θολώνει. Δεν μπορεί να συγκρατήσει τα νεύρα του και δυστυχώς δεν σκέφτεται τι κάνει. Με ασύλληπτη δύναμη χτυπάει το κεφάλι του στην μπασκέτα και σωριάζεται στο παρκέ.
Από εκείνο το λεπτό κι έπειτα η ζωή του Μπόμπαν δεν θα ήταν η ίδια. Το μπάσκετ κόβεται ακαριαία για τον Σέρβο καλαθοσφαιριστή ο οποίος λίγο αργότερα ζητάει από τον γιατρό του Πανιωνίου, να κάνει ότι μπορεί γιατί δεν νιώθει τα χέρια και τα πόδια του.
Μεταφέρεται στο νοσοκομείο, όμως η μοίρα του, φαίνεται πως είχε γραφτεί... Καθηλώθηκε σε αναπηρικό καροτσάκι ένας από τους πιο αθλητικούς παίκτες που πέρασαν ποτέ από την Ελλάδα. Ακόμα και τότε πάντως, ο Γιάνκοβιτς δεν το έβαλε κάτω, ούτε ενόχλησε κανένα, ούτε παραπονέθηκε για τίποτα.
Ο μεγάλος αυτός παίκτης δεν άντεξε, αφού η καρδιά του τον πρόδωσε και άφησε την τελευταία του πνοή το βράδυ της 28ης Ιουνίου του 2006, πηγαίνοντας για διακοπές στη Ρόδο.
Ο Μπόμπαν Γιάνκοβιτς όπου κι αν βρίσκεται, παίρνει χαρά καμαρώνοντας τον γιο του, Βλαδίμηρο, ο οποίος έχει ακολουθήσει τα χνάρια του πατέρα του στο μπάσκετ.